Bis vor einem Jahr gehörte ich auch zu den Leuten, die nur den Anime richtig kannten. Zwar wusste ich diverse Dinge (gerade das Finale) aus dem Manga, aber ich hatte es eben nicht selber gelesen.
Das mittlerweile nachgeholt bin ich auch der Meinung das beides seine Vorzüge hat.

Der Anime setzt vor allem auf viel Komik und wiederkehrende Motive. Bunny ist und bleibt die tollpatschige Heulsuse, die sich im Laufe der Serie nicht groß verändert - nur ein wenig erwachsener wird.
Ich bin immer noch der festen Überzeugung, dass der Anime sich auch eher an ein jüngeres Publikum richtet. Er ist kindlicher gehalten und die Thematik wird oftmals mehr oberflächlich behandelt, auch wenn die ein oder andere Sache durch Wiederholung dann doch vertieft wird.
Dazu kommt, dass der Anime mehr fünf einzelne Geschichten erzählt. Jeder Gegner und jeder damit verbundene Kampf zeigt "Meilensteine" im Leben der Kriegerinnen, an denen sie wachsen.

Der Manga hingegen ist sehr viel ernster, düsterer und tiefsinniger, wenn man es vergleicht. Insgesamt erhält man in dem Manga eine zusammenhängende Geschichte über 18 Bände. Auch wenn es einzelne Gegner sind, sind die Übergänge fast fließend und es wird auch immer mal wieder darauf zurückgegriffen. Bunny selbst wird schon anders dargestellt. Ihre Entwicklung kommt mir sehr viel tiefgründiger und weitreichender vor als im Anime. Und sie ist auch von vorneherein mit einer anderen Einstellung ausgestattet.

Ich denke beides ist in seinem Sinne gut. Ich persönlich mag den Manga in der Weise lieber, dass ich die Geschichte besser erzählt finde, weil sie mehr Tiefe hat und nicht versucht wird sie "zwangsläufig" aufzulockern durch diverse Witze.
Aber gerade für die mag ich dann den Anime manchmal lieber. Sind vollkommen unterschiedliche Sachen und genau die Unterschiede lassen mich auch zu keiner klaren Entscheidung kommen, was denn nun besser ist.